毛細(xì)管電泳儀每次運行間毛細(xì)管的清潔處理：

　　·在相同實驗條件下每個樣品之間的沖洗步驟應(yīng)只以運行緩沖液沖洗為佳，避免NaOH、水等物質(zhì)的沖洗。

　　·緩沖液沖洗的時間一般為2-5min，如果重復(fù)性不佳，可提高沖洗壓力或延長時間來嘗試提高實驗的重復(fù)性。

　　·若以上步驟還是難以達(dá)到理想的實驗重復(fù)性且出現(xiàn)每次出峰時間的后移情況，則是因為樣品中物質(zhì)在毛細(xì)管內(nèi)壁的吸附所引起，此時則需要使用0.1M　NaOH的沖洗，沖洗時間為2min左右，以去除毛細(xì)管內(nèi)壁上的吸附物，此后再用水和運行緩沖液較長時間沖洗，以確保緩沖液與毛細(xì)管內(nèi)壁之間的平衡穩(wěn)定形成。

　　·對于使用SDS或CTAB等表面活性劑的實驗，需要注意這些表面活性劑與毛細(xì)管表面之間的平衡對實驗重復(fù)性是至關(guān)重要的。所以此類實驗一般不采用NaOH洗毛細(xì)管，而是采用緩沖液的長時間沖洗和預(yù)電泳來提高實驗的重復(fù)性。當(dāng)實驗進(jìn)行到一定次數(shù)以后再用NaOH米清潔毛細(xì)管，并用運行緩沖液長時間沖洗獲得平衡。

　　毛細(xì)管插入樣品溶液后，應(yīng)立即開始進(jìn)樣操作，完成后迅速移至緩沖液中開始電泳。否則會產(chǎn)生毛細(xì)作用和虹吸現(xiàn)象，引起誤差并使譜帶展寬。

　　毛細(xì)管電泳儀使用操作：

　　1.電極不要和毛細(xì)管接觸，樣品貯器和緩沖液貯器液面的高度應(yīng)保持平衡。

　　2.使系統(tǒng)盡可能保持恒溫。因溫度直接影響粘度，而影響進(jìn)樣量的恒定。

　　3.樣品溶液中的溶劑需要與緩沖液互溶，前者的離子強度應(yīng)低于后者。

　　4.防止樣品溶液和緩沖液蒸發(fā)、損耗。